發(fā)布時(shí)間:2018-03-29 10:39 | 來(lái)源:南方日?qǐng)?bào) 2018-03-26 第A14版 | 查看:1239次
唐欣然在做實(shí)驗(yàn)。南方日?qǐng)?bào)記者 張梓望 攝
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實(shí)驗(yàn)室里的人都沸騰了!
得知論文在國(guó)際頂級(jí)腫瘤學(xué)專業(yè)期刊《柳葉刀·腫瘤學(xué)》刊登后,中山大學(xué)腫瘤防治中心鼻咽癌團(tuán)隊(duì)的研究人員面帶笑容,相互祝賀。第一作者唐欣然長(zhǎng)松一口氣,念叨著“終于可以畢業(yè)了”。
在論文中,唐欣然首次在世界范圍內(nèi)報(bào)道了一組mRNA分子標(biāo)簽密碼,由13個(gè)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移基因組成的分子標(biāo)志物將能有效預(yù)測(cè)局部晚期鼻咽癌轉(zhuǎn)移,可幫助臨床醫(yī)生更準(zhǔn)確地區(qū)分高?;颊撸瑸楸茄拾﹤€(gè)體化治療發(fā)展插上了翅膀。
科學(xué)家究竟是如何找到分子標(biāo)志物?為何不多不少,恰好是13個(gè)基因?這一過(guò)程運(yùn)用了哪些科學(xué)統(tǒng)計(jì)方法?帶著這些疑問(wèn),南方日?qǐng)?bào)記者走進(jìn)實(shí)驗(yàn)室,與科學(xué)家進(jìn)行了一場(chǎng)解密對(duì)話。
●南方日?qǐng)?bào)記者曹斯黃錦輝
狡猾“廣東瘤”
鼻咽癌勢(shì)頭兇猛!
在世界腫瘤地圖上,鼻咽癌在中國(guó)“全線飄紅”。數(shù)據(jù)顯示,中國(guó)鼻咽癌新發(fā)病例占全球的40%,其中尤其以華南地區(qū)為甚,發(fā)病率高達(dá)20—50人/10萬(wàn)人,遠(yuǎn)高于全球平均的1人/10萬(wàn)人。因此,它也被稱為“廣東瘤”。更可惡的是,鼻咽癌極為狡猾,其發(fā)病部位極其隱蔽,出現(xiàn)癥狀時(shí)往往已到中晚期。
眾所周知,癌癥之所以可怕,是因?yàn)樵诤笃?,惡性腫瘤細(xì)胞會(huì)在體內(nèi)“漂移”,從原發(fā)部位,經(jīng)淋巴結(jié)、血管或體腔等途徑,向人體的重要器官發(fā)起攻擊。這一過(guò)程被稱為是腫瘤的轉(zhuǎn)移。
中山大學(xué)腫瘤防治中心副院長(zhǎng)、專攻鼻咽癌防治30年的馬駿教授表示,就中心收治的病人來(lái)看,約有70%的鼻咽癌患者在就診時(shí)已經(jīng)處于局部區(qū)域晚期(無(wú)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移)。這些病人中有20%—30%的患者在治療后會(huì)出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移占死亡原因的75%。
遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移死亡率如此之高,若能提前發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞的“潛逃”軌跡,使用藥物全力圍剿,那患者的生存結(jié)局也許就能發(fā)生改變。
科學(xué)家不是沒(méi)有想過(guò)這一點(diǎn)。
在臨床上,若使用傳統(tǒng)腫瘤分期方法,預(yù)測(cè)鼻咽癌遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的準(zhǔn)確性僅為57%左右。更何況,在相同分期背景下,患者接受治療大致上相同,而生存結(jié)局卻總有不同。目前研究缺乏有效的標(biāo)志物指導(dǎo)鼻咽癌患者的治療方案選擇。
馬駿把它們看成是科研的尷尬,也是實(shí)驗(yàn)的“突破口”。團(tuán)隊(duì)成員開(kāi)始思考,既然傳統(tǒng)方式不夠精準(zhǔn),是否存在一種新方式,能幫助患者更好地預(yù)測(cè)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移?
分子生物學(xué)發(fā)展帶來(lái)了一絲曙光。
在過(guò)去幾年,國(guó)際醫(yī)療界研究已深入到分子生物領(lǐng)域。許多分子生物學(xué)指標(biāo)被納入腫瘤預(yù)后評(píng)價(jià)體系,甚至出現(xiàn)了分子分期的概念。2016年,美國(guó)國(guó)家癌癥綜合網(wǎng)絡(luò)指南“挑中”21-基因,將它推薦用于激素受體陽(yáng)性、淋巴結(jié)陰性的早期乳腺癌患者,以此來(lái)評(píng)估患者疾病復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。若檢測(cè)結(jié)果需要,臨床醫(yī)生將在內(nèi)分泌治療的基礎(chǔ)上增加化療。此外,在前列腺癌的相關(guān)研究中,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了相關(guān)分子標(biāo)志物。
這些突破給了馬駿不少啟發(fā)。他開(kāi)始思考,是否在一組基因的表達(dá)改變可以預(yù)測(cè)鼻咽癌患者的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)?如果有,是否可以用于指導(dǎo)臨床治療選擇?
揪出13個(gè)基因元兇
帶著這些假設(shè),馬駿教授團(tuán)隊(duì)開(kāi)展了現(xiàn)今國(guó)際最大規(guī)模的鼻咽癌分子標(biāo)志物研究。
在本中心的患者中,團(tuán)隊(duì)根據(jù)接受治療后有無(wú)出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移為標(biāo)準(zhǔn),挑選出24對(duì)鼻咽癌患者組織標(biāo)本。為控制實(shí)驗(yàn)誤差,減少干擾因素,實(shí)驗(yàn)人員嚴(yán)格控制患者的年齡、性別、腫瘤分期等因素。隨后,他們采用了表達(dá)譜芯片的方式,對(duì)比分析了患者的全基因組表達(dá)水平。
基因表達(dá)譜芯片對(duì)疾病研究有重大意義。一方面,它能應(yīng)用于疾病生物標(biāo)記物的篩選。另一方面,基因表達(dá)譜的檢測(cè)可以為基因功能研究提供線索,有助于揭示疾病發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制。
唐欣然表示,團(tuán)隊(duì)通過(guò)這種高通量方法,挑選出了具有表達(dá)差異的137個(gè)嫌疑基因。她解釋,作為多種分子事件調(diào)控靶標(biāo)的mRNA日益受到關(guān)注。經(jīng)過(guò)mRNA翻譯出的蛋白質(zhì)的量常被視為基因表達(dá)能力的強(qiáng)弱的指標(biāo)。
在生物界,存在著一個(gè)中心法則。DNA控制蛋白質(zhì)的合成。DNA核苷酸序列是遺傳信息的儲(chǔ)存者,其含量相對(duì)恒定。它能通過(guò)轉(zhuǎn)錄生成mRNA,進(jìn)而翻譯成蛋白質(zhì)來(lái)控制生命現(xiàn)象。
實(shí)驗(yàn)本質(zhì)上是一場(chǎng)數(shù)字游戲。從137個(gè)嫌疑基因到最終13個(gè)元兇,這一過(guò)程是如何操作的呢?
13個(gè)基因“元兇”本質(zhì)上是一份“榜單”。唐欣然介紹,在找到137個(gè)嫌疑人基因后,團(tuán)隊(duì)運(yùn)用了中通量檢測(cè)方法(137個(gè)mRNA),在數(shù)據(jù)分析上,從410多個(gè)病例中反復(fù)抽樣,隨機(jī)排列組織,累計(jì)重復(fù)2000次。抽樣結(jié)束后,系統(tǒng)會(huì)給出一個(gè)“榜單”,對(duì)137個(gè)基因進(jìn)行排名列次。在頻頻被翻盤的13個(gè)基因上插上“小紅旗”,構(gòu)建分子標(biāo)志物。唐欣然解釋,分子標(biāo)志物就像是預(yù)警器,通過(guò)測(cè)試鼻咽原位的腫瘤,來(lái)判斷它將來(lái)轉(zhuǎn)移遠(yuǎn)處器官的可能性大小。
在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,經(jīng)計(jì)算后發(fā)現(xiàn),當(dāng)基因個(gè)數(shù)達(dá)到13個(gè)時(shí),既能保證預(yù)測(cè)癌細(xì)胞遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的準(zhǔn)確率,又能幫助患者節(jié)省花費(fèi),一舉兩得。
科學(xué)家終于揪出了13個(gè)基因元兇。但工作遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒(méi)有結(jié)束。他們要做的還有下一步驗(yàn)證。
研究人員將這13個(gè)mRNA分子標(biāo)簽與N分期等臨床指標(biāo)相結(jié)合,總結(jié)歸納出了一條評(píng)價(jià)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)的公式,融入了敏感性和特異性的綜合評(píng)價(jià),在院內(nèi)的410例患者中,竟發(fā)現(xiàn)能將鼻咽癌預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性由57%提高至75%。隨后,該結(jié)果在佛山市第一人民醫(yī)院、桂林醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院的患者樣本中均得到了驗(yàn)證。
唐欣然介紹,實(shí)際上,對(duì)于預(yù)后評(píng)估來(lái)講,75%的準(zhǔn)確率已經(jīng)是較高水平。
為個(gè)體化治療支新招
在實(shí)驗(yàn)中,科研人員還將患者根據(jù)設(shè)定閾值分為高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組。他們運(yùn)用了ncounter技術(shù)平臺(tái)來(lái)進(jìn)行檢測(cè)。經(jīng)計(jì)算后,若患者風(fēng)險(xiǎn)系數(shù)高于之前設(shè)定閾值(5.01),則歸入高風(fēng)險(xiǎn)組;若低于5.01,則是低風(fēng)險(xiǎn)組。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),高風(fēng)險(xiǎn)組患者5年遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移率高達(dá)37%,低風(fēng)險(xiǎn)組僅為9%。
此外,研究還發(fā)現(xiàn),利用13個(gè)基因組成的分子標(biāo)簽可以區(qū)分鼻咽癌患者同期化療獲益人群。對(duì)于低轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)組的患者,其可以從接受同期化療中獲益,5年遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移率從16%降低至5%;而高風(fēng)險(xiǎn)組患者則無(wú)顯著改善,表明這部分患者可能需要進(jìn)一步強(qiáng)化治療,例如誘導(dǎo)化療,或者聯(lián)合靶向藥物甚至免疫治療等,有待進(jìn)一步研究證實(shí)。
“這項(xiàng)研究對(duì)臨床意義較大?!瘪R駿表示,它能有效預(yù)測(cè)局部晚期鼻咽癌轉(zhuǎn)移,幫助臨床醫(yī)生更準(zhǔn)確地區(qū)分高危患者,并為他們提供個(gè)體化的治療方案。
馬駿表示,下一步他們將開(kāi)展前瞻性研究——以現(xiàn)在為起點(diǎn)追蹤到將來(lái)的研究方法,將新收治患者分為高低風(fēng)險(xiǎn)組,對(duì)癥下藥,采取個(gè)體化治療方式,且將繼續(xù)優(yōu)化方案,爭(zhēng)取進(jìn)一步提高預(yù)后評(píng)估的準(zhǔn)確率。
作為后續(xù)研究,馬駿教授團(tuán)隊(duì)研發(fā)出了“鼻咽癌轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)試劑盒”,即一個(gè)可同時(shí)對(duì)13個(gè)鼻咽癌遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)基因進(jìn)行檢測(cè)的技術(shù)平臺(tái);該試劑盒采用的檢測(cè)標(biāo)本,取材自臨床常規(guī)可獲取的石蠟組織(FFPE),方便易行。
馬駿接受采訪時(shí)表示,目前試劑盒正在申報(bào)國(guó)家專利,正處于待審批過(guò)程中。試劑盒上市后,局部晚期鼻咽癌患者可以很便捷地接受這一檢測(cè),將有助于指導(dǎo)臨床醫(yī)生的治療選擇,低風(fēng)險(xiǎn)患者實(shí)行單純同期化療,對(duì)判斷為高遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)的患者實(shí)行積極隨訪和強(qiáng)化治療,為患者的個(gè)體化治療提供有力依據(jù)。
這支專攻鼻咽癌的團(tuán)隊(duì)在過(guò)去幾年里拿出不少成績(jī)。2012年,研究結(jié)果被新版《美國(guó)指南》采納,改變了全球沿用14年的治療方案,使中晚期患者避免了輔助化療帶來(lái)的痛苦;2009年和2016年,團(tuán)隊(duì)兩次改進(jìn)了評(píng)價(jià)鼻咽癌嚴(yán)重程度的分期標(biāo)準(zhǔn),使得治療方法更加有針對(duì)性;馬駿還帶著團(tuán)隊(duì)繪制了鼻咽癌治療的正常器官保護(hù)圖譜,將嚴(yán)重后遺癥率降低了24%。
回憶起三十年如一日的科研生涯,馬駿笑著說(shuō):“搞開(kāi)了,就收不住嘍。”
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