發(fā)布時間:2020-03-10 10:07 | 來源:科技日報 2020年03月10日 第04版 | 查看:597次
成科軒 本報記者 盛 利
這幾天,在成都市疾病預防控制中心新冠肺炎疫情應急指揮中心內(nèi),應急與業(yè)務管理辦公室主任庹曉莉正緊盯著“新冠肺炎密切接觸者采集分析系統(tǒng)”,一刻不松懈地工作著。作為成都市戰(zhàn)“疫”的眾多數(shù)據(jù)“大腦”之一,這套新系統(tǒng)從研發(fā)到上線,僅用了72小時。
從構(gòu)建患者接觸者實時采集分析系統(tǒng),到掌握疫情的流行特征,再到分析疫情時空分布規(guī)律……由成都市科技局支持的“成都地區(qū)新型冠狀病毒疫情應急響應模式的構(gòu)建及應用”應急科技攻關項目,正在成都市疾控中心加緊推進。而作為項目實施的“排頭兵”,該中心科研人員正與時間賽跑,在科研一線戰(zhàn)“疫”。他們中有人已“連軸轉(zhuǎn)”了1個多月,有人每天工作超過16個小時,密密麻麻的數(shù)據(jù)表格、數(shù)不清的深夜加班……近日,科技日報記者走近了這個用科技賦能戰(zhàn)“疫”的特殊群體。
72小時誕生實時采集分析系統(tǒng)
在辦公室里,庹曉莉需要一直對著電腦,緊盯著各種跳動的數(shù)據(jù)。從SARS暴發(fā)到“5·12”特大地震,從禽流感到甲型H1N1流感疫情,她一直是成都市突發(fā)公共衛(wèi)生事件的“逆行戰(zhàn)士”。
庹曉莉駐守的新型冠狀肺炎疫情應急指揮中心,是疾控指揮調(diào)度及信息匯總分析的樞紐,公眾高度關注的每日疫情數(shù)據(jù)即來源于此。疫情發(fā)生后,她每天工作超過13個小時,有時候甚至通宵加班,電話24小時在線,已成為她工作的常態(tài)。
在對密切接觸者的追蹤管理中,如何精準地實現(xiàn)信息共享和統(tǒng)計分析,是疫情決策的關鍵之一?!白铋_始我們采取用人工統(tǒng)計報表的方式,但隨著病人增多,密切接觸者數(shù)量愈發(fā)龐大,這給僅9人的追蹤統(tǒng)計工作組帶來挑戰(zhàn)。”庹曉莉說,在應急攻關項目的支持下,團隊在已有的疾病監(jiān)測系統(tǒng)上,僅僅用了72小時,就研發(fā)完成了“成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實時采集分析系統(tǒng)”的1.0版,它首次將所有確診病例、疑似病例及密切接觸者納入一個完整的數(shù)據(jù)庫,實現(xiàn)分級分類管理,快速追蹤。
“時間就是生命,我們必須分秒必爭?!扁諘岳蛘f,該系統(tǒng)研發(fā)期間,團隊成員每天都在緊張的防疫工作之余,“見縫插針”地商量、討論、修改,目的就是讓它能夠盡快上線。
目前,該系統(tǒng)管理的密接者累計已達到6000多人,庹曉莉仍在研發(fā)一線發(fā)力?!跋到y(tǒng)將繼續(xù)豐富信息采集、統(tǒng)計分析等功能,并實現(xiàn)數(shù)據(jù)可視化呈現(xiàn),把‘枯燥’的數(shù)字代表的意義表達出來?!扁諘岳蛘f。
5小時內(nèi)即可出接觸者“人物關系圖”
“過去14天去了哪些地方?搭乘了哪些交通工具?接觸了哪些人?”“吃飯的時候和誰坐在一起,和誰說了話?”疫情暴發(fā)后,岳勇所帶領的成都市疾控中心流行病學調(diào)查組,正奔波在各處醫(yī)院、隔離點。而這樣的現(xiàn)場調(diào)查,短則2—3小時,多則3—5小時。
隔著密不透風的防護服,艱難地記錄著每一次問答,分析著每一份數(shù)據(jù)和表格,岳勇只為找到疫情傳播的“蛛絲馬跡”,迅速確定所有密切接觸者。
岳勇,是成都市疾控中心流行病學調(diào)查組副組長、傳防科副科長。從1月15日起,他與他科室的12名“戰(zhàn)友”,就全部進入了“備戰(zhàn)”狀態(tài):白天,在疫情一線,詢問確診和疑似病例過去14天的活動軌跡和接觸人員,展開流行病學調(diào)查;晚上,在辦公室形成調(diào)查報告,分析可能的感染來源,初步預判高危風險的密切接觸者。
“從某種意義上來講,流行病學調(diào)查與刑警辦案一樣,越快地排查鎖定‘嫌疑人’,就越有利于案件偵破或減少案件再發(fā)?!痹烙抡f,團隊會把疑似或確診病例的行動軌跡、傳染案例畫成關系圖,分析成都所有確診病例傳染路徑、地區(qū)分布、人群特點;然后通過大數(shù)據(jù),最終形成“流調(diào)”報告,提出合理的預防對策和健康服務措施。
“目前我們對新冠病毒的了解有限,還需要不斷地加深認識,調(diào)查越深入、信息越細致,才能盡快掌握一手資料?!痹烙抡f。
用GIS系統(tǒng)探索病毒時空分布規(guī)律
在疾控中心微檢科收樣室,成都市疾控中心科研教育信息管理科副主任杜長慧正在審讀“流調(diào)”報告。在已掌握的數(shù)據(jù)基礎上,如何對病毒規(guī)律形成進一步的系統(tǒng)認識?杜長慧團隊正與微生物檢驗部門協(xié)作,借助GIS(地理信息)系統(tǒng),結(jié)合病原基因測序與進化分析,對病毒傳播進行分子溯源,探索病例的傳播模式及病毒進化的時空分布規(guī)律。
作為項目牽頭人之一,杜長慧團隊曾計劃在成都地區(qū)將諾如病毒的分子流行病學研究引入GIS系統(tǒng),研究病毒進化時空分布規(guī)律。
“它既可從整體探索疫情的時空分布規(guī)律,從群體角度構(gòu)建時空分析模式;也可以從個案出發(fā),構(gòu)建個體傳播軌跡展示技術?!倍砰L慧說。
經(jīng)過前期收集病例和密接的流行病學信息、采集病例的標本等,未來科研團隊還將建立基因測序方法,挑選合格標本進行測序與進化分析,整理并數(shù)字化流調(diào)信息,最終在GIS系統(tǒng)和分子溯源技術的助推下,展示新冠病毒的傳播模式及病毒進化的時空分布規(guī)律。
發(fā)表評論
網(wǎng)友評論
查看所有評論>>